本专业培养掌握制药工程方面的基本原理，能在医药、农药、精细化工和生物化工等部门从事医药产品的生产、科技开发、应用研究和经营管理等方面工作的技术应用型和市场适应型的复合型高级工程技术人才。
本专业在立足制药工程的基础上，以化学制药，药物化学为主要方向。主要学习制药工程方面的基本理论和基本知识，受到有关生物制药、化学制药、中药制药和药物制剂等方面的实验技能、工程实践、计算机应用、科学研究与工程设计方法的基本训练，具有对医药产品的生产、管理、工程设计、新药研究与开发的基本能力，努力培养学生具有创新意识和独立获取新知识的能力，并能从事本学科及相邻交叉学科的创新性工作。
主要课程：有机化学、化工原理、药物合成反应、药理学、药物化学、化学制药工艺学、制药分离工程、天然药物化学等。
